Zasady są takie:

- Jeśli gracz ma domenę Aquos, musi wykonywać misje w świecie Aquosa itp.
- Misje można wykonywać raz na dzień.
- W misjach nie wolno oszukiwać za oszustwa podczas misji grozi utrata jakiegoś bakugana albo pieniędzy.
- Podczas misji jeśli  zleci ktoś wam pokonanie 2 razy jakiegoś przeciwnika to nie możemy podać tych walk które wygraliśmy przed rozpoczęciem misji.
- Na początku misji gdy się zapiszemy wybieramy sobie poziom trudności, to od niego zależy jaką nagrodę się dostanie.